Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot2Q8C5L3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms