Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NcaphQ8C156 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NcaphQ8C156 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NcaphQ8C156 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NcaphQ8C156 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NcaphQ8C156 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NcaphQ8C156 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NcaphQ8C156 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NcaphQ8C156 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NcaphQ8C156 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcaphQ8C156 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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