Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccser1Q8C0C4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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