Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nhlrc2Q8BZW8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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