Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Snx17Q8BVL3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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