Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy1Q8BIJ7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rufy1Q8BIJ7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms