Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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