Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms