Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim19Q80ZU4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms