Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ttc28Q80XJ3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms