Protein–RNA interactions for Protein: Q80WT0

Jph4, Junctophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph4Q80WT0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jph4Q80WT0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms