Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed4Q80WQ9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms