Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms