Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Syne1Q6ZWR6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Syne1Q6ZWR6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Syne1Q6ZWR6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Syne1Q6ZWR6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms