Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Topbp1Q6ZQF0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms