Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms