Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms