Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Herc4Q6PAV2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms