Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms