Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smchd1Q6P5D8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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