Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sp140Q6NSQ5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sp140Q6NSQ5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sp140Q6NSQ5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sp140Q6NSQ5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sp140Q6NSQ5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sp140Q6NSQ5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sp140Q6NSQ5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sp140Q6NSQ5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp140Q6NSQ5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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