Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms