Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Krt40Q6IFX3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Krt40Q6IFX3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Krt40Q6IFX3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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