Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Pkp4Q68FH0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Pkp4Q68FH0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Pkp4Q68FH0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Pkp4Q68FH0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Pkp4Q68FH0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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