Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpd52Q62393 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms