Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Odf1Q61999 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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