Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lcp1Q61233 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lcp1Q61233 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms