Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rbbp4Q60972 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms