Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnot7Q60809 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnot7Q60809 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms