Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P4ha1Q60715 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms