Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CttnQ60598 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms