Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NacadQ5SWP3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NacadQ5SWP3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NacadQ5SWP3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NacadQ5SWP3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NacadQ5SWP3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NacadQ5SWP3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NacadQ5SWP3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NacadQ5SWP3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms