Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bod1Q5SQY2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bod1Q5SQY2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bod1Q5SQY2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Bod1Q5SQY2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms