Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trappc3lQ4KL14 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc3lQ4KL14 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms