Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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BC051142Q3V0M8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051142Q3V0M8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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BC051142Q3V0M8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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