Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn13Q3UW68 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms