Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec31aQ3UPL0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sec31aQ3UPL0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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