Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarca4Q3TKT4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms