Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RubcnlQ3TD16 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms