Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hddc2Q3SXD3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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