Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim71Q1PSW8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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