Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc39dQ0VF76 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc39dQ0VF76 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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