Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spata18Q0P557 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms