Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neurl1bQ0MW30 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Neurl1bQ0MW30 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms