Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc21bQ0HA38 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms