Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms