Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a2Q07643 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms