Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pfdn6Q03958 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pfdn6Q03958 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pfdn6Q03958 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pfdn6Q03958 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pfdn6Q03958 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pfdn6Q03958 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pfdn6Q03958 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pfdn6Q03958 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pfdn6Q03958 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn6Q03958 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn6Q03958 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn6Q03958 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn6Q03958 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn6Q03958 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn6Q03958 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn6Q03958 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn6Q03958 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn6Q03958 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn6Q03958 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn6Q03958 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn6Q03958 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn6Q03958 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn6Q03958 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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