Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcd1Q02242 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcd1Q02242 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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