Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms